L’électrophorèse sur gel est une technique largement utilisée dans les laboratoires des sciences de la vie pour séparer les macromolécules telles que l’ADN, l’ARN et les protéines. Dans cette technique, les molécules sont séparées en fonction de leur taille et de leur charge électrique.
Comment fonctionne l’électrophorèse ?
Le gel utilisé en électrophorèse sur gel est généralement fabriqué à partir d’un matériau appelé agarose, qui est une substance gélatineuse extraite d’algues. Ce gel poreux pourrait être utilisé pour séparer des macromolécules de nombreuses tailles différentes. Le gel est immergé dans une solution tampon du sel dans une chambre d’électrophorèse. Le tris-borate-EDTA (TBE) est couramment utilisé comme tampon. Sa fonction principale est de contrôler le pH du système. La chambre a deux électrodes – une positive et une négative – à ses deux extrémités.
Les échantillons à analyser sont ensuite chargés dans de minuscules puits sur le gel à l’aide d’une pipette. Une fois la charge prête, un courant électrique de 50-150 V est appliqué. Maintenant, les molécules chargées présentes dans l’échantillon commencent à migrer à travers le gel vers les électrodes.
La vitesse à laquelle chaque molécule se déplace à travers le gel s’appelle sa mobilité électrophorétique et est principalement déterminée par sa charge nette et sa taille. Les molécules fortement chargées se déplacent plus rapidement que les molécules faiblement chargées.
Une fois la séparation terminée, le gel est coloré avec un colorant pour révéler les bandes de la séparation. Le bromure d’éthidium est un colorant fluorescent couramment utilisé en électrophorèse sur gel. Le gel est trempé dans une solution diluée de bromure d’éthidium puis placé dans un transilluminateur ultraviolet pour visualiser les bandes de séparation. Les bandes sont immédiatement examinées ou photographiées pour référence future, car elles se diffuseront dans le gel au fil du temps.
Systèmes de documentation de gel
Il ne faut pas oublier que l’électrophorèse sur gel est l’un des principaux outils des laboratoires de biologie moléculaire, cellulaire et biochimique. En fait, il reste l’une des principales approbations et essais demandés lors de la publication de résultats importants. Pour cette raison, les chercheurs ont besoin de systèmes à haute résolution et de plusieurs systèmes de reconnaissance d’images pour traiter les gels. De ce point de vue, le traitement des gels nécessite la plus grande sensibilité pour assurer la qualité des résultats.
Actuellement, le développement numérique permet de disposer d’analyseurs d’images ou de systèmes de documentation sur gel, spécifiquement conçus pour s’adapter aux besoins et au budget du laboratoire. Ceux-ci fournissent des solutions innovantes pour la capture et l’analyse d’images, et sont configurés en fonction des techniques utilisées par chaque chercheur.
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